Effects of the February 6 earthquake on the agents growing in urine cultures and antibiotic resistance rates
Muhammet Serdar Bugday1, Ersoy Oksuz2, Ayten Gunduz3, Feyza Inceoglu41Department of Urology, Malatya Turgut Ozal University Faculty of Medicine, Malatya, Turkiye2Department of Medical Pharmacology, Malatya Turgut Ozal University Faculty of Medicine, Malatya, Turkiye
3Department of Medical Microbiology, Malatya Turgut Ozal University Faculty of Medicine, Malatya, Turkiye
4Department of Biostatistics, Malatya Turgut Ozal University Faculty of Medicine, Malatya, Turkiye
OBJECTIVE: The aim of this study was to investigate the effects of the February 6 earthquake on the bacteria grown in urine cultures and antibiotic resistance of patients admitting to the urology outpatient clinic.
METHODS: In this study, 11397 urine samples requested by the urology outpatient clinic between January 2022 and December 2023 were examined. We evaluated the urine cultures and antibiotic resistance profiles of the pathogens in patients clinic in years 2022 and 2023 separately and post-earthquake year 2023 as two separate periods as the first 6-month period immediately after the earthquake. The pathogens grown in urine cultures and antibiotic resistance profiles were examined retrospectively. Only one of the same strains isolated in consecutive repeated growths in the urine cultures of the patients was included.
RESULTS: Of the 11397 urine cultures, 6914 were requested in 2022 and 4483 were requested in 2023. There was no statistical difference in the growth rate between the years (13.1%-14.1%). When the demographic data of the first and last 6 months of 2023 were compared, statistical differences were found between the first and last six months of 2023 in terms of the number of patients for whom culture was requested, the number of culture positives, the reproduction rate, and the number of male and female patients. The total number of patients for whom urine culture was requested was 4483 (1471 in the first six months - 3012 in the last six months) (p=0.008) and the number of culture-positive patients was 630 (184-446) (p=0.007). The reproduction rate were found to be 12.5% and 14.8%, respectively (p=0.047). It was found that the resistance rates of Escherichia coli (E.coli) to gentamicin (GN), cefuroxime (CXM), cefixime (CFM) and ceftazidime (CAZ) groups of antibiotics was higher in the first six-month period of 2023 (p<0.05). Similarly, the resistance rate of Klebsiella spp. to CXM and CAZ group of antibiotics was found to be higher in the first six-month period of 2023 (p<0.05).
CONCLUSION: The results of our study show that the conditions in communal living areas after the February 6 earthquake had an increasing impact on antibiotic resistance rates and antibiotic resistance rates of certain groups of antibiotics, especially the Enterobacterales group were higher in the first half of 2023.
6 Şubat depreminin idrar kültürlerinde üreyen etkenler ve antibiyotik direnç oranları üzerine etkileri
Muhammet Serdar Bugday1, Ersoy Oksuz2, Ayten Gunduz3, Feyza Inceoglu41Malatya Turgut Özal Üniversitesi Tıp Fakültesi, Üroloji Anabilim Dalı, Malatya2Malatya Turgut Özal Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Farmakoloji Anabilim Dalı, Malatya
3Malatya Turgut Özal Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Malatya
4Malatya Turgut Özal Üniversitesi Tıp Fakültesi, Biyoistatistik Anabilim Dalı, Malatya
AMAÇ: 6 Şubat depreminin üroloji polikliniğine başvuran hastaların idrar kültürlerinde üreyen bakterilere ve antibiyotik dirençleri üzerine etkisini araştırmayı amaçlandı.
YÖNTEMLER: Çalışmamızda Ocak 2022-Aralık 2023 tarihleri arasında üroloji polikliniğinden istenen 11397 idrar örneği incelendi. 2022 ve 2023 yılı kendi içinde, deprem sonrası 2023 yılı da 2 dönem halinde ayrı ayrı değerlendirildi. 2023 yılı 2 dönemin birinci dönemi depremin hemen akabinde özellikle çadırda ve ortak tuvalet kullanımının olduğu alanlarda yaşamın fazla olduğu ilk 6 aylık dönem ve 2. dönemi ise akut dönem sonrası konteyner gibi bireysel tuvalet ortamının sağlandığı alanlarda yaşamın daha fazla olduğu ilk 6 ay sonrasındaki dönem olarak belirlendi. 2022ve 2023 yılı ve 2023 yılının iki dönemi idrar kültürlerinde üreyen patojenler ve bu patojenlerin antibiyotik dirençleri açısından karşılaştırılarak retrospektif olarak incelendi. Hastaların ardışık tekrarlayan üremelerinde izole edilen aynı suşlardan sadece biri çalışmaya alındı.
BULGULAR: 11397 idrar kültürünün 6914’ü 2022 yılında, 4483’ü 2023 yılında istenmiştir. Üreme oranı olarak yıllar arasında istatistiksel bir fark saptanmamıştır yoktu (%13,1-%14,1). 2023 yılı ilk ve son 6 aya ait demografik verilerine bakıldığında kültür istenilen hasta sayısı, kültür pozitif sayısı, üreme oranı, erkek ve kadın hasta sayılarına göre 2023 yılının ilk ve son altı ayları arasında istatistiksel farklılık yoktu. Kültür istenen toplam hasta sayısı 4483 (ilk altı ay 1471- son altı ay 3012) (p=0.008), kültür pozitif hasta sayısı 630 (184-446) (p=0.007), üreme oranı sırasıyla %12.5’a %14,8 (p=0.047) olarak bulunmuştur. Escherichia coli (E.coli) için gentamisin (GN), sefuroksim (CXM), sefiksim (CFM) ve seftazidim (CAZ) antibiyotiklerinde 2023 yılının ilk ve son altı ayları arasındaki değişimlerde istatistiksel farklılık yoktu (p<0.05). İlk altı aylık dönemde direnç oranının daha yüksek olduğu görüldü. Klebsiella spp. İçin CXM ve CAZ antibiyotiklerinde 2023 yılının ilk ve son altı ayları arasındaki değişimlerde benzer şekilde ilk altı aylık süreçte oranın yüksek olduğu saptandı. (p<0.05).
SONUÇ: 6 Şubat depremi sonrası toplu yaşam alanlarının özellikle Enterobacterales grubunda antibiyotik oranlar üzerinde etkisi olduğu ve toplu yaşam alanlarının kullanıldığı 2023 yılı ilk yarısında belirli grup antibiyotiklerin direnç oranlarının daha yüksek olduğu tespit edilmiştir. (NCI-2025-1-6)
Manuscript Language: English