Association of childhood asthma with Gasdermin B (GSDMB) and Oromucoid-like 3 (ORMDL3) genes
Mehmet Almacioglu1, Ozlem Keskin2, Mehmet Yasar Ozkars2, Sibel Oguzkan Balci3, Ercan Kucukosmanoglu2, Sacide Pehlivan4, Mehmet Keskin51Department of Pediatrics, SANKO University Faculty of Medicine, Gaziantep, Turkiye2Department of Pediatric Allergy and Immunology, Gaziantep University Faculty of Medicine, Gaziantep, Turkiye
3Department of Biology, Gaziantep University Faculty of Medicine, Gaziantep, Turkiye
4Department of Biology, Istanbul University Faculty of Medicine, Istanbul, Turkiye
5Department of Pediatrics, Gaziantep University Faculty of Medicine, Gaziantep, Turkiye
OBJECTIVE: Genome-length association studies have shown that Gasdermin B (GSDMB) and Orosomucoid-like 3 (ORMDL3) genes located on the long arm of chromosome 17 are associated with asthma. In this study, it was aimed to determine the possible relationship between asthma control test (ACT), exercise provocation test (ECT), and fractional nitric oxide (FENO) levels and GSDMB and ORMDL3 gene expressions.
METHODS: 59 asthmatic and 38 non-asthmatic children were included in the study. We divided the patient group into two subgroups as mild persistent asthma (29 patients) and moderate persistent asthma (30 patients). ORMDL3, GSDMB gene expression levels, ECT, total IgE levels, and eosinophil counts were measured in all cases. In addition, ACT and FeNO levels were measured in children with asthma. Afterward, the relationship of ORMDL3 and GSDMB gene expression coefficient changes with ECT, ACT, and FeNO was examined.
RESULTS: When patients with ACT ≤15 were compared with patients with ACT ≥20, ORMDL3 and GSDMB gene expressions were increased 6.74 and 11.74 times, respectively. Comparing patients with ACT ≥20 and ACT ≤15 in terms of coefficient changes (ΔCq), higher change values were observed for ΔCq ORMDL3 in patients with ACT ≤15 (p=0.015). Similarly, when patients with FENO ≤25 ppb were compared with patients with FENO >25 ppb, ORMDL3 and GSDMB gene expressions were increased by 2.93 and 3.56 times, respectively. When the coefficient changes were compared, no significant difference was found between FENO≤25 and FENO >25 patients. There was a slight negative correlation between ΔCq values and ACT score (p=0.003, r=-0.418 for ORMDL3, and p=0.016, r=-0.345 for GSDMB). In addition, we observed a statistically significant positive correlation between ORMDL3 and GSDMB gene expressions (r=0.80, p<0.001).
CONCLUSION: We showed that increased ORMDL3 and GSDMB gene expression levels may be associated with ACT scores, FeNO and ECT in asthma. These findings may encourage future studies with larger numbers of subjects that can use gene expression levels in various asthma phenotypes for prognostic prediction.
Çocukluk astımının Gasdermin B (GSDMB) ve Oromucoid-Like 3 (ORMDL3) genleri ile ilişkisi
Mehmet Almacioglu1, Ozlem Keskin2, Mehmet Yasar Ozkars2, Sibel Oguzkan Balci3, Ercan Kucukosmanoglu2, Sacide Pehlivan4, Mehmet Keskin51SANKO Üniversitesi Tıp Fakültesi, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı, Gaziantep2Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi, Pediatrik Alerji ve İmmünoloji Anabilim Dalı, Gaziantep
3Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi, Biyoloji Anabilim Dalı, Gaziantep
4İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi, Biyoloji Anabilim Dalı, İstanbul
5Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı, Gaziantep
Amaç: Genom boyu ilişkilendirme çalışmaları, 17. kromozom uzun kolunda yer alan Gasdermin B (GSDMB) ve oromucoid benzeri 3 (ORMDL3) genlerinin astımla ilişkili olduğunu göstermiştir. Bu çalışmada, astım kontrol testi (ACT), egzersiz provokasyon testi (ECT) ve fraksiyonel Nitrik Oksit (FENO) düzeyleri ile GSDMB ve ORMDL3 gen ekspresyonlar arasında olabilecek ilişkinin belirlenmesi amaçlandı.
Yöntemler: 59 astımlı ve 38 astımı olmayan çocuk çalışmaya dahil edildi. Hasta grubu hafif persistan astım (29 hasta) ve orta persistan astım (30 hasta) olarak iki alt gruba ayırdık. Olguların tamamında ORMDL3, GSDMB gen ekspresyon düzeyleri, egzersiz provokasyon testi (ECT), total IgE seviyeleri ve eozinofil sayıları bakıldı. Ayrıca astımlı çocuklarda, astım kontrol testi (ACT) ve FeNO düzeyleri ölçüldü. Sonrasında ORMDL3, GSDMB gen ekspresyon katsayı değişimlerinin ECT, ACT, FeNO ile olan ilişkisine bakıldı.
Bulgular: ACT ≤15 olan hastalar ACT ≥20 olan hastalar ile karşılaştırıldığında ORMDL3 ve GSDMB gen ekspresyonlarının sırasıyla 6,74 ve 11,74 kat arttığı görüldü. Kat sayı değişimleri (ΔCq) açısından ACT ≥ 20 ile ACT ≤15 olan hastalar karşılaştırıldığında ΔCq ORMDL3 için ACT ≤15 olan hastalarda daha yüksek değişim değerleri gözlendi (p: 0.015). Benzer şekilde FENO ≤25 ppb olan hastalar FENO >25 ppb olan hastalar ile karşılaştırıldığında ise ORMDL3 ve GSDMB gen ekspresyonları sırasıyla 2,93 ve 3,56 kat artmıştı. Kat sayı değişimleri karşılaştırıldığında ise FENO ≤ 25ve FENO >25 hastalar arasında anlamlı fark bulunmadı. ΔCq değerleri ile ACT skoru arasında hafif düzeyde negatif korelasyon saptandı (ORMDL3 için p=0.003, r=-0.418 ve GSDMB için p=0.016, r=-0.345). Ayrıca, ORMDL3 ile GSDMB gen ekspresyonları arasında istatistiksel olarak anlamlı bir pozitif korelasyon gözlemledik (r=0.80, p<0.001).
Sonuç: Artmış ORMDL3 ve GSDMB gen ekspresyon düzeylerinin astımda ACT skorları, FeNO ve ECT ile ilişkili olabileceğini gösterdik. Bu bulgular, prognostik tahmin için çeşitli astım fenotiplerinde gen ekspresyon seviyelerini kullanabilen daha fazla sayıda denek ile gelecekteki çalışmaları teşvik edebilir. (NCI-2022-10-14)
Manuscript Language: English